
在癌症细胞图谱计划的三项研究中,研究人员发现了以前未知的驱动癌症的蛋白质之间的相互作用,并将这些新数据结合起来,生成了一幅蛋白质通路图,显示了癌症的结果。
他们的方法提供了一个框架,可以提高科学家对癌症进展的理解,并有助于确定治疗目标。对于许多癌症,这是遗传疾病,有一个广泛的基因突变目录。但是,将这些突变组织成驱动肿瘤生长的途径的综合地图却缺失了。Ran Cheng和Peter K. Jackson在一篇相关文章中写道:“如果肿瘤生长的关键机制被更好地整合到特定的途径中,就会出现更清晰的画面。”“识别和巩固这些途径,以及确定这些途径的组合如何驱动癌症,将简化我们寻找有效的癌症治疗方法。”
蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络是这项工作的重要工具,因为它们超越了基因列表,可以定义肿瘤通路和可药物靶点的蛋白质生物化学。Danielle Swaney等人研究了头颈部鳞状细胞中蛋白质-蛋白质相互作用的数据。他们报告说,这些癌细胞系与非癌细胞系以及彼此之间的相互作用相比,显示出数百种不同的相互作用。与PI3K通路的相互作用——通常在肿瘤中发生突变——可以预测药物反应,Swaney和他的同事报道。
Minkyu Kim等人关注乳腺癌,发现了两个与肿瘤抑制基因BRCA1相关的蛋白,以及两个调节PIK3CA的蛋白。Fan Zheng等人将Swaney等人和Kim等人的新PPI数据与现有的公共数据相结合,生成了蛋白质通路图,他们利用该图揭示了以前难以检测到的在肿瘤转移中可能重要的突变。这些研究提供了有助于解释癌症基因组数据的资源。
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